青墩小学创建于1958年秋天。青墩原属新兴人民公社管辖，后因划分公社时才开始筹建尖南小学（原校名）。由于刚建国不久，经济落后，特别是农村条件极为艰苦，无法新建校舍，负责筹建工作曾松林校长，经过多次磋商、协调借用了潭尖五组的四间队房做教室，教室不够实行复式班教学，还有的学生借住在周边的邻居家上课。
1959至1960年袁东春任副校长。
1960年至1961年袁浩接任副校长。
1961年至1964年袁东春任校长。
1962年秋因发大水，校舍倒塌，学校由原潭尖五组搬迁至现校址三尖港，更名青墩小学。现校址原是老农业中学，当时农业中学已停止招生，只有9间砖瓦结构的房屋。
1964年袁东春校长调社教队工作。
1964年至1968年温启浩任校长。
1968年温启浩调自然小学任校长。
1968年至1972年戴炳文任主任，代校长。
1971年全国学制改革，小学五年制，并在小学设初中班。
1972年至1977年张如松任学校校长。
1973年新建前两幢砖瓦结构的教室。
1974年新建后两幢砖瓦结构的教室。
1971年至1975年青墩小学分别在龙碾村九组和地龙村设有小农场。
1976年青小创办了文艺高中班，为培养文艺人才作出了贡献。
1977年张如松调青墩中学任校长。
1977年至1983年温启浩任校长。
1981年后青墩小学不设初中班。
1982年青墩小学的两歌两舞轰动全郊区，盐城市副市长陈必亭、市教育局副局长顾克美、郊区教育局罗放局长等一行数人来学校开现场会，三至六年级学生全部参加表演。
1983年温启浩调任青墩乡文卫助理，1983年仓泽夫任校长。
1983年7月学校开挖鱼塘，建石拱桥、喷泉。
1986年8月撤旭日教学点并入青墩小学。
1992年8月吴国华调青墩小学任校长，仓泽夫、沈金才离任。
1993年1月一号教学楼建设正式启动，并在短期内完成规划、环评等工作；5月一号教学楼开工，次年1月通过验收交付使用，建筑面积1440平方米，工程投资77万元。
1997年8月撤龙碾教学点并入青墩小学。
1998年8月金中斌任青墩小学校长。
1999年10月撤潭尖小学并入青墩小学。
2002年8月撤洋湾小学并入青墩小学。
2002年9月填平东水沟、建筑栅栏式围墙，投入9.2万元。
2002年9月改建生活区学生宿舍，投入6.5万元。
2003年8月撤正东小学、盐中小学并入青墩小学。
　　2005年8月改建东北二号教学楼，次年2月通过验收交付使用，建筑面积686平方米，工程投资35万元。
　　2005年填西生产河（时任盐城市副市长朱恒菊视察我校作重要批示，并下拨专项资金25万元）
　　2005年8月鱼塘驳岸，建防护栏杆，投资15万元。
　　2005年7月生活区食堂改造，搭建活动房，改建水冲式测所，共投资39万元。
　　2005年8月撤曰康小学、龙庙小学并入青墩小学。
　　2006年8月孙开祥任青墩小学校长，金中斌任协管员。
　　2006年9月投入8.5万元建筑西面栅栏式围墙，实现校园封闭。
　　2006年8月撤潭南教学点并入青墩小学。
　　2007年8月开学校东门、建东传达室，投入11万元。
　　2008年10月撤曰青教学点并入青墩小学。
　　2009年建学校生态园，投资8.5万元。
　　2010年春新建三号教学楼，建筑面积为1880平方米的四层教学楼，建筑投资320万元，次年秋学期开学正式建成交付使用。
　　2011年暑期一号教学楼加固维修，投资7万元。
　　2011年秋教职工安居工程正式启动。
　　2011年春塑胶跑道、小足球场、操场工程正式启动，次年春学期通过验收交付使用，投资77万元。
　　2012年2月生态园改造，移植高贵树木，投资15万元。
　　2012年4月铺设地下电路，重建大门楼，扩宽中心路，重新浇筑混凝土。
　　2012年2月撤红升小学并入青墩小学。
　　2013年11月青墩中心幼儿园由青墩小学托管，孙开祥兼任青墩中心幼儿园园长。
　　2014年8月董金荣任青墩小学校长。